咬肌肥大没有治疗的办法，咬肌肥大一般都是由于病人偏侧咀嚼，被咀嚼侧的咬肌会出现肥大，而非咀嚼侧的咬肌比较薄，更显得咀嚼侧的咬肌肥大。这就像经常运动的人，被运动的肌肉比较大、比较结实，而不运动的人或者长期卧床的人，肌肉会发生萎缩。
虽然没有治疗的办法，但是可以预防，嘱咐病人要两侧交替咀嚼，不能长期用单侧咀嚼。如果病人已经出现一侧咬肌肥大，要改变这种不良的咀嚼习惯，要两侧交替咀嚼，可能会好一些。