得了细菌性的阴道炎，治疗时选用抗厌氧菌的药物，主要有甲硝唑、替硝唑、克林霉素。甲硝唑可以抑制厌氧菌的生长，而不影响乳酸杆菌的生长，是理想的治疗细菌性阴道炎的药物，可以全身用药，首选甲硝唑400mg口服，每日2次，共7天。其次，可以应用替硝唑2g口服，每日1次，连续3天。
也可以口服克林霉素300mg，每日2次，连服7天。局部用药可以应用甲硝唑制剂，比如甲硝唑泡腾片200mg，每晚1次，连用7天，或者是2%的克林霉素软膏阴道涂抹，每次5g，每晚1次，连用7天。