患者性生活的时候小肚子疼，通常有两种情况：
1、最常见的就是妇科的盆腔炎症，比如子宫内膜炎、附件炎，也就是盆腔炎，这都可以引起夫妻性生活时患者小肚子疼，而且炎症的轻重，也导致了腹痛的轻重；
2、也就是不常见的，比如宫外孕、腹腔有积血的时候，在性生活时患者也会感觉到肚子疼，这个是比较少见的。
所以性生活的时候小肚子疼，初步考虑是由妇科盆腔炎所引起，需要到医院做彩超，再加内诊检查即可确诊。