脚上长了疣，首先可以应用物理治疗的方法进行祛除，临床上推荐患者应用激光、冷冻、电灼、光动力的方式祛除。应用软膏是可以的，但是，一定要在医生的指导下进行应用，不然这些外涂药膏很可能会对周围正常皮肤组织造成不良反应。临床上祛除疣常用的药膏，如维A酸软膏、氟尿嘧啶软膏、咪喹莫特软膏。
等到疣体祛除以后，患者可以配合干扰素软膏进行外涂，可以有效祛除局部的HPV病毒。脚上长疣患者一定要注意清洁卫生，个人鞋袜一定要专人专用，不能与其他人混用，一定要避免反复抓挠长疣的部位，不然可能会造成自体种植的情况发生。