胃肠感冒和急性肠胃炎的区别可分为三点：
第一、病史方面，胃肠型感冒的患者多有劳累、受凉的病史，而急性胃肠炎的患者多有在外就餐、用食或食用生冷、不洁食物的病史。
第二、临床表现，急性胃肠炎患者的症状相对较重，胃肠道的症状如腹泻、呕吐、发热、消化不良等较明显，而胃肠型感冒的临床症状除胃肠道症状，如消化不良、恶心、呕吐、腹泻甚至腹胀外，还包括全身的症状，比如头痛、咳嗽、咽痛、流涕等症状。
第三、治疗方面，急性胃肠炎需要针对病原进行治疗，也就是针对感染的细菌，需要使用抗生素来治疗。而胃肠型感冒作为病毒感染，胃肠道的症状较轻，对症治疗即可。