细菌性阴道病，它的治疗选用抗厌氧菌的药物，主要有甲硝唑、克林霉素，甲硝唑抑制厌氧菌的生长，而不影响乳酸杆菌的生长，是比较理想的治疗药物，但对支原体效果比较差。口服药物首选甲硝唑或者克林霉素。局部药物的治疗，用2%的克林霉素软膏阴道涂布，或者甲硝唑泡腾片。局部用药与口服用药疗效相似，治愈率大概在80%。
性伴侣的治疗，这个病虽然与有多个性伴侣有关，但是对性伴侣给予治疗，并未改善治疗效果及降低复发，因此，性伴侣不需常规的治疗。