新生儿总是呛奶，首先要考虑病理性的因素，也就是在疾病状态下引起的新生儿吞咽不协调，总是发生呛奶，常见的有新生儿鼻腔疾病，如后鼻孔闭锁，新生儿鼻腔不通气导致在食奶的过程中不能很好的换气，容易发生呛奶。要看口腔有无腭裂，腭裂有时候有食道和气道相通，可能会导致新生儿呛奶。要考虑是否有气管、食管瘘，在食奶的过程中，由于奶汁从瘘口流到气管流到肺部，就导致新生儿容易发生呛奶。另外，要考虑新生儿是否有先天性的喉软骨发育不良，以及新生儿是否有严重的肺部疾病，或先天性的心脏病等等。
总之，新生儿呛奶原因比较多，首先要排除疾病的因素，再要考虑是否喂养不当，如新生儿本身吞咽不协调，在吃奶的过程中容易发生吃吃停停，在吃奶间歇期可能奶汁流速过快，也容易导致新生儿发生呛奶。反复呛奶容易导致新生儿吸入性的肺炎，要及时去就医，排除呛奶相关的病理性因素。