肠镜下切除息肉较安全，没有什么风险，这种技术现在已经很成熟了。若息肉距离肛门较远，只能选择电子结肠镜下进行切除。较小的息肉可用活检钳直接夹除，较大的息肉可用镜下电刀烧灼，然后送病理学检查。
直肠息肉或结肠息肉发现后最好早期切除，息肉本身是良性肿物，但有一定癌变风险，是一种隐患。临床循证医学证明早期切除直肠息肉也是预防直肠癌发生的有效方式之一，所以发现后应尽早处理。