肝内多发囊肿，一般是肝脏的良性肿瘤。此类情况需要患者排除其他疾病，一类就是考虑肝脏的转移性肿瘤，此类疾病的排除需要患者查上腹部增强CT，以及肿瘤标记物的排除。另外一种情况患者需要排除肝脏的脓肿。
脓肿患者会有发热、寒战等情况。另外，患者需要考虑多囊肝、多囊肾的可能，此类疾病是遗传性疾病，查彩超多提示肝脏多发小囊肿以及双侧肾脏多发小囊肿。此类疾病是遗传性疾病，暂无特殊有效药物治疗，需要患者及时观察，看囊肿直径大小的变化。
如果囊肿超过一定的直径，需要患者及时行穿刺引流，保护肝功能以及肾功能。如果排除了以上疾病，患者多诊断为单纯的肝脏多发性囊肿。对于此类疾病，多建议患者观察，每半年1年复查上腹部彩超，看囊肿直径大小的变化，如果囊肿超过5cm，建议患者行腹腔镜下肝囊肿去顶引流术，或者行彩超引导下肝囊肿穿刺引流，并且在引流完毕之后，经导管注入无水酒精，进一步毁损囊壁。