在临床上，肛周脓肿会引起患者出现疼痛，但是因为肛周脓肿的位置不同而有所不同。通常比较表浅的肛周脓肿，主要表现为肛周的持续性、跳动性的疼痛，患者行动不便，坐卧不安，但是全身症状不明显，病变的地方常常有明显的红肿，而且有硬结和压痛，甚至有的时候还可以触及波动感，穿刺的时候可以抽出脓液。位置比较深的肛周脓肿，在临床上会出现持续性的胀痛，逐渐的加重，而且可以发展为持续性的跳痛，患者会出现坐立不安、排便或者行走时疼痛加剧，也可以出现排尿困难和里急后重的感觉，而且有相一部分病人会出现全身的感染症状，比如头痛、乏力、发热、恶心、寒战、食欲不振等。肛周脓肿一旦出现，均应及时的进行手术治疗。