骨结核是一种难治性疾病，因为骨结核是由于结核杆菌在骨内形成的炎症。它会造成骨质的破坏，形成局部的寒性脓肿，造成局部的死骨，并且细菌会潜伏在骨小梁的间隙内，不宜被清除掉。
轻度的骨结核，需要全身应用抗结核药物治疗，对于已形成骨脓肿者，需要进行手术，局部病灶彻底清理，局部使用链霉素药株或者抗结核药物进行治疗。待二期炎症完全消退后需要进行局部的植骨治疗，将局部的骨缺损填充，后期通过骨长入补充缺损部位，才能完全治愈，因此骨结核治疗是比较麻烦的。