化脓性扁桃体炎的患者大多咽痛剧烈，在咽口水时也感到明显的疼痛。因此对于化脓性扁桃体炎的患者，治疗上最好以静脉输液为主，主要使用抗生素，有青霉素类或者头孢类抗生素。如果治疗2-3天后没有明显好转，可以酌情使用糖皮质激素，比如地塞米松。
如果患者有明显的发热症状，可以口服解热镇痛药。此外，平时饮食上要注意清淡，给予流质饮食，加强营养，注意休息，还要疏通大便。如果每年发作三次以上，在炎症完全消退后2-3周，可以考虑切除双侧扁桃体。