骶管囊肿多大并不是决定手术的唯一指征，在临床上更常见的是根据骶管囊肿是否引起症状，而进行手术指征的选择。一般来说，对于引起明确症状的骶管囊肿，即使囊肿体积比较小，也应该考虑手术治疗。
有一些骶管囊肿虽然体积相对较大，但是位于骶管的骶1-2水平，并没有造成骶神经的明确受压，患者的症状也不明显。对于这种无症状的骶管囊肿，虽然体积较大，也不需要手术治疗，可以在临床上随诊观察，如果出现与骶管囊肿相关症状的时候再考虑手术治疗。