以目前的医疗水平暂时对于脑细胞没有明显的再生治疗手段，所以小脑萎缩这类疾病的治疗效果整体偏差，同时不同病因所导致的小脑萎缩其治疗手段以及治疗效果也不完全一样。
如果是由于老年退行性改变所导致的小脑萎缩，以改善脑循环以及改善脑细胞代谢为主要药物治疗手段，同时辅助以在生活上促进患者脑功能锻炼指导，但这些治疗主要是以延缓脑萎缩进行性加重为主要目的，对于已经丧失掉的脑功能，没有明显的治疗效果。
如果是由于颅内占位压迫局部血管所导致的萎缩，需要手术治疗解除占位效应，改善供血。