N99口罩可以防病毒，根据国家卫健委发布的口罩使用指南，专家建议在医疗防护环境需要防护级别的N95口罩，N99口罩和N95口罩同属于美国国家职业安全卫生研究所颁布的口罩标准。
N95指口罩对0.3微米的非油性颗粒的过滤效率可达到95%，而N99过滤效率可以达到99%。从过滤效率来看，N99的防疫能力更好。
当然，因为防护等级更高，N99口罩佩戴时的呼吸难度和不舒适感要大于N95口罩。所以普通民众防疫，有条件的情况下可以选择N99，但是一般情况下N95级别的口罩已经足够。