通常情况下，使用双氧水擦伤口肯定是会疼的，但疼痛程度的轻重，还要看伤口面积有多大以及个人对疼痛的敏感度来说。一般伤口面积比较大，需要用双氧水擦拭的面积也就较多，肯定要比伤口小的患者疼痛程度要重一些。个人对疼痛的敏感度也不一样，所以有同样的伤口面积，使用同样多的双氧水，一个可能会觉得很疼；另一个可能会觉得有点疼。
抛开个人对疼痛的敏感度来看，造成双氧水擦伤口会疼的主要原因，是因双氧水的成分，会跟伤口的血以及伤口的分泌物产生化学反应。而导致疼痛的最主要因素，就在这个化学反应的过程中，这个过程中会由于杀灭伤口深部的一些厌氧菌以及其他细菌，以及病毒、微生物等，从而导致刺激到伤口，接着则会出现疼痛。