在临床上，畸胎瘤的治疗方式通常是以手术切除治疗为主，具体治疗需要根据肿瘤性质决定，具体如下：
1、良性畸胎瘤：病人在手术后并不需要进行术后的辅助治疗；
2、恶性畸胎瘤：病人需要按照恶性肿瘤的治疗原则进行处理，比如睾丸恶性畸胎瘤的病人，在手术中既要将睾丸进行切除，同时还应该做腹膜后淋巴结清扫手术。如果病人的身体状态比较差，不能够进行腹膜后淋巴结清扫，可以采用腹膜后的放射治疗，能够起到与外科手术治疗相似的效果。还有一部分恶性畸胎瘤的病人，在手术治疗之后还需要进行化疗，能够进一步延长恶性畸胎瘤病人的生存期。