对于肝囊肿手术的费用，根据治疗的方式不同其花费也不同。如果患者肝囊肿确诊之后超过5cm，此时行彩超引导下经皮经肝肝囊肿穿刺引流术，如果应用的是ptcd穿刺管，此类治疗的花费一般在5000元左右；如果行腹腔镜下去顶引流术，此类治疗的花费大概在6000-10000元左右。具体应视所在地区以及医院等级的不同收费有不同。另外，由于居住的地域不同，如沿海地区或内陆城市，由于住院费用以及消费水平的不同，其花费的治疗费用也不同。所以，患者应综合考虑所处的地域、就诊的医院以及自己的病情、治疗的方式综合考虑费用，准备住院费用。