肥厚型心肌病在临床上主要是β受体阻滞剂，比如普萘洛尔、美托洛尔、钙离子拮抗剂、硝苯地平、氨氯地平或者维拉帕米，能够减轻流出道的肥厚心肌收缩、降低流出道梗阻程度、增加心每搏输出量，也可以治疗室性的心律失常。治疗原则是能够弛缓肥厚的心肌，防止心动过缓及维持正常的窦性心律，减轻左心室流出道的狭窄和抗湿性的心律失常。在给予改善心肌代谢药物的时候，要观察疗效还有副作用，如果用洋地黄应该警惕发生中毒。