先天性心脏病的患者，其常见的病因有3个：1、胎儿周围的环境因素，母亲在妊娠的早期出现了子宫内的病毒感染，主要是风疹病毒的感染，其次是柯萨奇病毒的感染，这样的母亲生出来的胎儿往往患有先天性的心脏病。2、遗传因素，大约5%的先天性心脏病的患者，是发生在同一家族的，而且病种比较相同或相似，可能主要是因为基因的异常或者染色体的畸变所导致的。当然，这也是主要导致先天性疾病的原因。3、地区的差异，有些高原地区、动脉导管未闭及房间隔缺损等这些先天性心脏病的发病率都比较高，考虑可能与高原地区缺氧有关。