输尿管结石手术依据手术方式不同，价格各不相同。传统手术，即腰部切开输尿管切开取石手术，是一种有创的手术方式，其手术费用约为1500元左右。经尿道输尿管镜下钬激光碎石，是一种微创手术，它通过尿道进入输尿管，将结石击碎、取出，手术费用约为2600元左右。
经尿道输尿管镜下气压弹道碎石手术，也是一种微创手术，手术费用约为2000元左右。经皮肾镜输尿管结石碎石、取石手术，通过腰部一个5mm左右的通道进入肾脏，由肾脏进入上段输尿管，将结石击碎，并将残石取出，也属于微创手术的一种，手术费用约为3000元左右。