尿道结石的检查方法有无创检查法和有创检查法。无创的检查方法包括尿道X平片、尿道造影、尿道CT检查，通常B超检查不容易发现尿道结石，故尿道结石不推荐行B超检查，多推荐行尿道CT检查。CT检查可以明确尿道结石的大小、位置、距离尿道口的长度，还可以了解尿道结石的密度。
有创的检查方法为尿道镜检查，其有一定的痛苦，检查完后可能合并血尿或尿道外口滴鲜血的情况，需要用特殊的镜体由尿道进入，观察结石的大小、位置，并且可以完成一系列镜下操作，如将结石通过尿道镜推入膀胱，再行碎石和取石治疗。