胆结石的疼痛在临床上称为胆绞痛，主要是与胆汁淤滞、胆道细菌感染有关。所以在临床上治疗胆绞痛，通常采用禁食、胃肠减压。可以使用制酸剂，如奥美拉唑，减轻胃肠道液体的分泌，从而减轻对胆汁酸分泌的刺激，解决疼痛。
可以同时使用654-2解痉剂，解除胆道梗阻，减轻胆绞痛的症状。如果合并有细菌感染，通常需要使用抗生素，以杀灭细菌、减轻细菌感染引起的胆绞痛症状。极为少见的胆结石可引起急性胆源性胰腺炎，通常需要使用生长抑素控制胰腺炎引起的腹痛。