脑血栓都是因为长期的高血压、糖尿病、高血脂等控制不佳，造成血管弹性减弱、血管内膜脂质层沉积，从而以引起动脉粥样硬化、动脉斑块形成，然后继发性造成血管狭窄。
在内膜不稳定的时候，狭窄部位可突发的形成血栓，从而引起脑血栓，也就是脑梗死出现。还有一部分病人可继发于房颤，房颤患者心脏血栓脱落可造成脑血管急性栓塞，从而引起脑栓塞临床症状。