肥厚性心肌病是一种可能跟遗传因素有关的心肌病变，表现为心室肌肥厚，在治疗上比较困难。如果临床上没有症状，可以用β受体阻滞剂或非二氢吡啶类钙拮抗剂延缓心室重构，延缓病情进展。
如果药物不能改善或者维持，可以考虑非药物治疗包括起搏器植入、化学消融或者外科手术的方式治疗。如果出现房颤等心律失常，除了要控制心律失常之外，还应该预防心脏内血栓的形成。建议用华法林，用药过程中注意监测出凝血时间或国际标准化比值，即INR。