肛瘘术后的愈合时间，跟肛瘘本身的复杂程度以及患者本人的体质有关系。大部分的肛瘘的愈合时间在术后一个月左右，程度更复杂的肛瘘愈合时间相对要延长，有的术后的愈合时间要40天、50天，甚至两个月。一般年轻的患者、体质强壮的患者愈合时间相对要短，年老体弱的患者、有慢性病的患者，愈合时间相对会更长。肛瘘术后愈合跟术后的换药也有很重要的关系，如果术后换药不到位，愈合时间会相对延长，甚至会造成假性愈合。