在临床上，婴儿消化道出血的症状，根据婴儿的出血部位、出血量、出血速度的不同，表现也有所差异。
通常如果婴儿是上消化道出血，多表现为黑便，而且婴儿的黑便多呈柏油样，伴或者不伴有呕血的情况。但是，如果出现呕血，一般呈咖啡样。如果出血量大，可能呕出来的血呈鲜红色或者有血块。
婴儿下消化道出血，多表现为便血，便血的颜色多呈暗红色，甚至是鲜红色。婴儿消化道出血起病比较急，而且病情比较重，患者的出血量比较大，通常会表现为头晕、乏力、心悸、出汗、恶心、口渴。
婴儿消化道出血，由于一部分患儿不能叙述自己的症状，所以，还会出现精神萎靡、烦躁不安，有的患儿还会出现反应迟钝、意识模糊。