幼儿脑积水的原因分为先天性脑积水和后天性脑积水，先天性脑积水一般是指先天畸形所致脑积水，包括中脑导水管狭窄、第四脑室中孔和侧孔闭锁等，后者可伴有脑积水和脊柱裂，此外约有1/4的脑积水病因不明；后天性脑积水主要原因可能是，产生后的颅内出血，新生儿和婴儿期的化脓性、结核性和其他种类脑膜炎，它们容易造成脑内某些部位发生病变，比如说第四脑室开口、环池、中脑和小脑幕游离缘之间间隙的继发粘连，导致脑脊液流通障碍，还可发生大脑表面蛛网膜下腔的粘连，从而导致后天性的脑积水。