肥厚型心肌病主要与高血压性心脏病、冠心病、心绞痛、先天性心脏病、主动脉瓣狭窄等进行鉴别。肥厚型心脏病病人的年龄比较年轻，临床表现或者心电图中可以出现类似冠心病的表现，但是又不能用上述这些疾病来进行解释。心电图表现中可以出现病理性Q波，左室肥大，伴有ST-T的改变，胸前导联也可以出现巨大倒置的T波。超声心动图可以出现明显的表现，显示室间隔非对称性性肥厚，运动低下。在询问病史的时候多有家族史，这样就更有利于疾病的诊断。