吃普萘洛尔或者阿替洛尔、美替洛尔、维拉帕米、地尔硫卓治疗肥厚型心肌病，目标就是解除症状和控制心律失常。普萘洛尔属于β受体阻滞剂，能够使心肌收缩减弱，从而减轻流出道梗阻，减少心肌耗氧，增加舒张期扩张，并且减慢心率，增加心脏搏出量，一般是最早应用，逐步增加剂量，以求改善症状。
心率和血压不过低，可以服用维拉帕米，可使症状长期缓解，对于血压过低、窦房功能或房室传导障碍者需要慎用。