龟头炎的检查分为体格检查和实验室化验检查。体格检查即医生通常对病情进行评估检查，需要在采光良好的检查室内脱去衣裤，充分暴露外生殖器。
检查包皮长度是否过长，翻开包皮完全暴露龟头，检查龟头有无红肿、有无斑片、有无出疹、有无异常分泌物、冠状沟是否积聚分泌物。如有分泌物，可适当留取分泌物做进一步的检查，可用棉签探查龟头是否有触击疼痛。
实验室检查为细菌涂片检查和细菌培养检查，即用棉签拭子擦拭龟头表面，做玻璃涂片检查，观察有无革兰氏阴性菌或杂菌；墨汁染色观察有无念珠菌感染；细菌培养可明确培养出是何种细菌感染，并可以做药物敏感试验针对性的选取药物治疗。