双侧附睾囊肿是可以不采取治疗措施，附睾囊肿和性生活刺激或慢性感染炎症有关。附睾囊肿不会引起临床症状，当附睾囊肿较大时会引起阴囊坠胀感和阴囊不适。在治疗上来说要慎重选择手术切除，药物治疗对于附睾囊肿没什么效果。
附睾囊肿切除后可能会对生育造成影响，因此对于未婚、未育男性，在患有附睾囊肿时选择手术的治疗方式要慎重。如果对于双侧附睾囊肿，可以选择做有症状的一侧。对于已有生育、症状严重的患者，可以考虑手术治疗。因此，附睾囊肿的治疗要根据病情症状和是否婚育酌情选择。