很多女性在体检的时候都发现有卵巢囊肿，卵巢囊肿在早期往往没有明显的临床症状，刚刚发生卵巢囊肿的时候女性不会出现任何的表现，只是在体格检查、妇科检查或者是超声检查的时候，发现卵巢或者是附件区有囊性肿物。
如果是卵巢生理性囊肿，在整个发生直到消失的过程中都不一定会出现临床症状，但是有的时候卵巢生理性囊肿过大，也可能会由于卵巢囊肿的破裂造成下腹部疼痛的症状。另外，卵巢子宫内膜异位囊肿也就是我们常说的卵巢巧克力囊肿，卵巢巧克力囊肿往往会伴随有痛经的症状，还有些女性会出现有不孕症的表现。
另外，还有卵巢的炎性肿物，由于盆腔的炎症所造成的卵巢囊肿，会出现右下腹部疼痛或者有发烧的症状，尤其是当抵抗力下降的时候卵巢囊肿出现明显的急性发作，这个时候发烧、腹痛就会同时发生。