扁桃体位于患者的口咽部位，扁桃体肥大可以导致患者出现呼吸功能、吞咽功能以及发音功能障碍。儿童的扁桃体肥大，大多数伴有腺样体肥大，可以出现睡眠打呼噜、张嘴呼吸憋气憋醒等临床表现。
另外，扁桃体肥大的患者可导致鼻咽部的炎性分泌物排出受阻，容易刺激腺样体增生肥大，堵塞咽鼓管咽口，可能会引起听力下降以及耳闷等表现。成人的扁桃体肥大也能导致咽腔的明显狭窄，导致患者出现睡眠时打呼噜、呼吸暂停、憋气憋醒等临床表现。
肥大的扁桃体，均可以导致成年人或者是儿童吞咽的时候出现局部的阻碍感，导致患者吞咽不畅。肥大的扁桃体堵塞咽腔，导致咽腔的共鸣腔变小，也可能导致患者的发音受限、发音含糊不清。