在临床上肛瘘主要是由于肛周脓肿自行破溃之后或者术后，引起肛旁肿痛以及流脓血水的症状。当肛瘘处于急性发作期，肛门疼痛比较明显，而且会有恶臭、脓血、分泌物流出。
如果处于静息期，肛旁只会有淡淡的清稀液体流出。对于这种情况，建议患者尽早去医院肛肠科选择探针探查或者盆底核磁共振检查。
在临床上对于肛瘘的治疗主要是选择肛瘘切除手术，尽早的清除内口以及瘘管，才能根治肛瘘。肛瘘如果长期不治疗、反复发作，可能会诱发肛瘘病变或者出现复杂性肛瘘，严重的会影响患者的正常生活。