卵巢小囊肿如果直径小于5cm，并且没有合并任何不舒服，查肿瘤指标CA12-5、CA19-9、CEA、AFP，均在正常范围之内，对于这种情况是不需要特殊处理的，一般建议患者月经干净之后复查妇科彩超。如果卵巢囊肿直径大于5cm，并且是持续存在，对于这种情况，建议患者考虑手术治疗。
一般包括卵巢囊肿剥除手术以及患侧的附件切除手术两种。对于患者年龄比较大，没有生育要求，可以选择患侧附件切除手术。如果患者有生育要求，年纪比较小，可以选择患侧卵巢囊肿剥除手术。