巧克力囊肿CA125上升，提示患者可能存在重度的内膜异位症，或者有可能有深部的内膜异位病灶。一般情况下，在诊断早期内异症时，CA125上升不会太明显，所以此种情况下，建议检查腹腔液中的CA125值，此时的检测值可能较血清的值更有意义。另外，如果患者是巧克力囊肿术后，可以用于评估治疗的效果或者预测是否有复发的可能。如果术后出现CA125上升，可能预测有复发可能，目前治疗疗效不太好。对于巧克力囊肿CA125升高，需要尽快去医院就诊检查，明确下一步处理和治疗。