小便出血刺痛最常见的原因是尿路感染，多数会有尿频、尿急、尿痛、血尿等症状。部分感染较重的患者还会出现发热、寒战、腰痛等症状。也有可能是泌尿系结石导致的，如果结石较小，随着尿液可以自行排出。在排出的过程中，有可能损伤尿道，从而引起出血以及刺痛。男性还有可能是前列腺炎导致的。
为了确诊需要去医院做尿常规，泌尿系彩超等检查。如果确诊为泌尿系感染，需要应用消炎药物治疗，如果是结石，出血一般是由较小结石导致的，结石一般能自行排出，不需要药物治疗。如果结石较大，嵌顿在输尿管或尿道，可以通过输尿管镜取石。