舌咽神经痛是出现于舌咽神经分布区的剧烈阵发性疼痛。疼痛性质与三叉神经痛有一定程度的相似性，二者的区别主要在于疼痛发生的部位不同。舌咽神经痛主要发生在一侧舌根、咽喉、扁桃体、耳根部或下颌后部，部分患者可有耳根部疼痛或耳前区域部分疼痛，此类疼痛是间歇性发作的。在吞咽、咀嚼、讲话或打喷嚏时可诱发咽喉部剧烈疼痛，疼痛可持续几秒钟、数十秒钟或数分钟不等，部分患者因疼痛剧烈或害怕疼痛而拒绝进食、说话、刷牙、洗脸等行为。