治疗寻常疣的药膏有很多，其中最主要的就是一些抗病毒类的药膏，比如可以外用一定的干扰素凝胶外涂，这样可能会起到一定的治疗效果，也可以适当的外涂酞丁安软膏进行治疗。如果寻常疣的疣体比较大。
也可以适当的外涂氟尿嘧啶软膏进行治疗。如果患者产生寻常疣后使用这些药膏仍然起不到明确的效果，可以通过一定的物理治疗来进行清除，通常可以采用液氮冷冻或者是激光的办法进行治疗，也可以采用手术切除的办法来治疗。