巧克力囊肿是子宫内膜异位症，这种囊肿里含有陈旧性的血液，一旦巧克力囊肿破裂以后，这些血液就会进入腹腔，刺激腹膜，引起剧烈的下腹部疼痛，有时候是难以忍受的。所以，一旦出现巧克力囊肿破裂，必须尽快进行手术治疗。
巧克力囊肿不会单纯出现的，有时候双侧卵巢以及子宫的周围，都可能会有子宫内膜异位症。子宫内膜异位症主要的表现是下腹部疼痛、盆腔粘连，会引起不孕症。如果囊肿破裂，会进一步加重病情，所以，必须尽快进行手术治疗。