抑郁症的发病机理是由于神经元功能的缺陷造成，如果经过系统、科学、规范的治疗，抑郁症得到缓解的患者，他的大脑神经元损害是有限的，甚至是没有损害的；但是如果对于慢性反复发作的患者，他的大脑神经元的损害可能是长期的、不可逆转的。已经有研究显示慢性的抑郁症患者，做CT之后，他的大脑的一些结构跟正常人相比有病理的变化。