肾结石0.9cm有可能严重，也有可能不严重。结石0.9cm要看肾结石所长的位置，如果肾结石长在盏颈口，有可能会引发肾盏积水，这个时候就需要治疗，药物治疗可以口服排石药物，如枸橼酸氢钾颗粒、结石通胶囊、尿石通胶囊等。
如果长期嵌顿在这里，药物治疗效果不好，需要做体外震波碎石或者需要做输尿管软镜钬激光碎石术治疗。9cm的肾结石如果长在肾盂里面，可能会比较严重，因为它会引起排尿通道梗阻，这时就需要手术治疗，最常见的就是输尿管软镜钬激光碎石取石术，也可以考虑体外震波碎石。
如果是胱氨酸结石，可以考虑口服碳酸氢钠，也有可能需要消融。0.9cm的肾结石如果是长在肾下盏，可能不严重，因为它不会堵塞肾的排尿通道，可以不需要做特殊的治疗，定期观察，如果结石长大再行相应的处理。