原发性肝癌的发病一般是多种元素协同作用的结果，常见的病因一般有以下几种：
1、肝硬化：约70%的原发性肝癌发生在肝硬化的基础上，且多数是慢性乙肝、丙肝发展而成的结节性肝硬化。当乙型肝炎病毒、丙型肝炎病毒感染与酒精或者是非酒精性脂肪肝、肝病并存时，肝癌发生的风险更大。
2、病毒性肝炎：是原发性肝癌诸多致病因素中最主要的因素，首先以慢性乙肝、丙肝最为常见，其次是酒精性肝病，长期饮酒能促进肝脏炎症相关的肿瘤启动因子的产生。另外，长期大量饮酒还可以诱发肝硬化进而促进肝癌的发生。
3、其他因素：长期食用受黄曲霉毒素污染的物品可能会诱发肝癌。