肾结石引起肾功能衰竭的治疗，需要区分是急性肾功能衰竭，还是慢性肾功能衰竭。如果是急性肾功能衰竭，尿路梗阻在3个月之内，可以采用体外冲击波碎石、经皮肾镜取石术以及手术等治疗，解除尿路梗阻。如果肾结石暂时无法处理，可放入DJ管。当尿路梗阻解除以后，肾功能会迅速恢复。如果血肌酐很高或者有高钾血症，可暂时给予血液透析治疗。如果是慢性肾功能衰竭，也需要通过体外冲击波碎石、经皮肾镜取石术以及手术等治疗方法处理结石，挽救残余的肾功能，同时服用尿毒清颗粒或者海昆肾喜胶囊等，进行排毒治疗。如果已经达到尿毒症期，需要给予长期血液透析治疗。