尿毒症透析相关的副作用，有急性和慢性之分。血液透析的相关急性副作用，主要表现在毒素水平降低速度过快，出现失衡综合征。在透析期间出现头晕、恶心等低血压表现，还会出现严重的心律失常，或者因为抗凝剂使用过量导致脑出血。同时，也会出现心脏骤停或者心绞痛等心血管事件。如果是首次透析，还会出现首次使用综合征，比较罕见的可以发生溶血、出血以及空气栓塞，或者对透析器过敏产生发热反应。远期并发症可以出现贫血、透析骨病、腕管综合征、骨软化症。腹膜透析最常见的副作用，是腹膜功能硬化和失功，以及出现腹膜炎、腹部感染等情况。