怀孕41天阴道有褐色分泌物，一般见于以下四个方面：
第一个，妇科检查可以看一下是否存在宫颈息肉情况。如果有宫颈息肉，也会出现阴道少许褐色分泌物。
第二个，有可能出现先兆流产，主要是B超检查发育正常，抽血检查提示胚胎发育情况良好，但是又存在漏胎的情况，跟个人的休息是有关系的。
第三个，宫外孕的可能性，特别是伴有下腹部胀痛、坠胀感觉的时候，一定要通过B超检查，排除是否宫外孕的可能性。
第四个，有可能存在稽留流产，也就是胚胎发育不良的情况，这种情况也可以通过抽血以及B超检查明确。
怀孕41天有褐色分泌物，一定要通过检查，清楚到底是什么原因，再进行相应的治疗，不可盲目保胎。