青光眼药物治疗时，应该注意各种药物的禁忌症。前列腺素类药物，例如适利达、苏为坦、卢美根等等禁用于葡萄膜炎、黄斑囊样水肿及妊娠妇女。噻吗心安、美开朗、贝他根则禁用于哮喘、慢性阻塞性肺部疾病、心脏传导阻滞、充血性心衰、体质虚弱、重症肌无力患者。派立明滴眼液禁用于有磺胺类药物过敏者。毛果芸香碱禁用于有高度近视、无晶状体眼以及有视网膜裂孔的患者。乙酰唑胺或醋氮酰胺则禁用于有肾结石、对磺胺类药物过敏的患者。