腋臭手术后后遗症是局部皮肤愈合不理想造成的疤痕过重，或局部出现一些毛囊炎的反应。手术以后半年内皮肤的抵抗能力下降，如果不注意局部卫生，就可能引起细菌繁殖引起毛囊炎。腋臭根治手术不彻底，大汗腺破坏不充分，出现局部复发的情况。还有的后遗症是手术方法不得当，一些传统的手术方法造成局部腋下的疤痕过大，引起一些疤痕的挛缩反应，导致肩关节因疤痕的挛缩造成活动受影响的牵拉反应。