碘伏的杀菌原理，主要是通过氧化细胞原浆蛋白的活性基团，并且与氨基结合，从而达到使病原体氨基酸和酶变性，实现杀菌目的。
碘伏是目前应用相当广泛的杀毒剂，是单质碘与聚乙烯吡咯烷酮的不定型结合物。
由于单质碘具有毒性和腐蚀性，所以医用碘伏的浓度通常比较低，为0.5%-1%之间，但是杀毒效果是比较不错的，具有广谱杀菌的作用，可以杀灭细菌繁殖体，严重真菌以及部分病毒。
医用碘伏的刺激性比较小，几乎没有副作用，被广泛用于临床消毒，建议患者如果出现皮肤黏膜破损或者比较轻微的皮外伤，可以考虑使用碘伏进行消毒处理，以免出现破损部位发炎。